Jefes

          Los Jefes son los enemigos principales de cada mapa y los más difíciles de vencer de este. Siempre se dirá (indirectamente) quienes son y no se puede seguir el camino si no se les vence. También existe el Jefe Final, que no es un Jefe de algún mapa, sino que es el principal enemigo de todo el juego.
          En el juego los Jefes son portadores de La Plaga tipo 6 y el Jefe Final de La Plaga Madre. Casi siempre los enfrentas al final de cada mapa y sin matarlos no puedes pasar al siguiente.
          Los Jefes por mapa y el Jefe Final son los siguientes:

- Jefe del Pueblo: Bitores Méndez

          Este Jefe lo enfrentas en una cabaña al final del Pueblo y posee el Ojo de Cristal Rojo, que al matarlo se puede conseguir. Este sirve para abrir la puerta de entrada al Castillo.

- Jefe del Castillo: Ramón Salazar

          Jefe al cual enfrentas en un salón gigante al final del Castillo. Sin matarlo éste no se puede degradar y dejar al descubierto la puerta de salida para ir a la Isla.

- Jefe de la Isla: Jack Krauser

          Es el único Jefe que no se enfrenta al final del mapa. Sin vencerlo no puedes conseguir la tercera pieza del rompecabezas de la puerta para seguir el camino. Lo enfrentas antes de llegar a la base militar central, esto se explica porque aparte de este Jefe, en la Isla también debes vencer al Jefe Final. También cumple la función de Jefe Final en el contenido extra Assignment Ada y de Sub Jefe en Separate Ways.

- Jefe Final: Osmund Saddler

          Es el último Jefe del juego y no posee ubicación (mapa) propia, sino que gobierna en todas. Lo enfrentas al final de la Isla en una construcción sin terminar y si no lo matas no puedes salir de la Isla, acabar con la secta y ganar el juego. También es el Jefe de el contenido extra Separate Ways.